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Questions et réponses sur les effets de l’utilisation des antibiotiques dans l’élevage, selon le BfR

3
fév
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Classé dans Contamination, Contamination croisée, Curiosité, Santé, Sécurité des aliments, Union Européenne.

« Questions et réponses sur les effets de l’utilisation des antibiotiques dans l’élevage », Mise à jour des FAQ du BfR du 21 janvier 2016

Antibiotic-pill-300x200Lorsque les animaux sont malades, il peut être nécessaire de les traiter avec des médicaments. Les antibiotiques ne peuvent être administrés à des animaux producteurs de denrées alimentaires en particulier que lorsqu’ils sont prescrits par un vétérinaire.

Les aliments ne peuvent être commercialisés si ils ne contiennent pas de résidus susceptibles de compromettre la santé des consommateurs. Si les antibiotiques sont utilisés conformément à leur destination dans l’élevage des animaux, il n’y a pas de résidus dangereux dans les aliments, à condition que le temps d’attente prescrit ait été respecté. Remerciements à la réglementation et aux contrôles stricts, le risque pour la santé des consommateurs par la consommation d’aliments est faible, quand les résidus d’antibiotiques sont concernés.

L’utilisation d’antibiotiques dans l’élevage favorise le développement de la résistance et la propagation de bactéries présentant une résistance. La résistance aux antibiotiques signifie que les pathogènes ne sont pas sensibles à certains antibiotiques. Il n’a pas été possible jusqu’à présent, cependant, d’estimer les conditions dans lesquelles l’utilisation d’antibiotiques dans l’élevage contribue au problème de la résistance en médecine humaine.

Dans le procédés de production alimentaire, les bactéries résistantes dans l’élevage peuvent être transférées aux aliments tels que la viande et le lait. Des pathogènes résistants peuvent également être transférés aux consommateurs par le biais des aliments, ainsi que par contact direct avec les animaux d’élevage, et peuvent déclencher des infections chez l’homme dans certaines circonstances. Si un traitement est nécessaire et que l’antibiotique administré n’a pas d’effet, les infections par des bactéries résistantes peuvent durer plus longtemps ou être plus graves.

Pour éviter que la nouvelle augmentation de la résistance, le BfR est d’avis que l’utilisation des antibiotiques dans l’élevage devrait être limitée au niveau minimum nécessaire pour la thérapie. L’accent devrait être mis sur les mesures qui maintiennent les animaux en bonne santé afin que le traitement par des antibiotiques ne devienne pas nécessaire en première intention. Un concept de minimiser l’utilisation des antibiotiques dans l’élevage a été légalement établi avec le 16e amendement du German Medicinal Products Act (AMG).

NB : Traduction par mes soins. -aa

Le communiqué se poursuit avec la liste des questions suivie des réponses :

Changement dans le mode de vie : Bacillus cereus est capable de résister à certaines thérapies antibiotiques

25
jan
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Classé dans Contamination, Curiosité, Environnement, Microbiologie, Santé, Sécurité des aliments.

« Changement dans le mode de vie : Bacillus cereus est capable de résister à certaines thérapies antibiotiques », source communiqué de University of Veterinary Medicine, Vienna.

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B. cereus au microscope sous forme de vaiants à petites colonies.(Photo: Markus Kranzler / Vetmeduni Vienne)

La bactérie pathogène Bacillus cereus provoque des vomissements et de la diarrhée ainsi que des infections systémiques et locales telles que des infections septicémiques ou oculaires. Une équipe de Vetmeduni de Vienne a signalé pour la première fois que B. cereus, suite à un contact avec certains antibiotiques, peut basculer dans un mode spécial ralenti. Les bactéries forment alors des variants à petites colonies (small colony variants ou SVCs) qui sont difficiles à diagnostiquer et presque impossible à traiter avec certains antibiotiques. Ce mécanisme nouvellement découvert peut fournir une explication alternative pour la résistance aux antibiotiques. Les résultats ont été publiés dans la revue mBio.

  1. cereus avait jusqu’ici été considéré comme formant exclusivement des endospores. En réponse à des conditions difficiles, les bactéries forment des endospores de protection leur permettant de rester en dormance pendant des périodes prolongées. Lorsque les conditions sont plus favorables, les endospores se réactivent pour devenir des bactéries pleinement opérationnelles.

Elrike Frenzel, Markus Kranzler et Monika Ehling-Schulz de l’Institut de microbiologie de l’Université de médecine vétérinaire de Vienne ont désormais démontré pour la première fois que B. cereus a un mode de vie alternatif sous forme de variants à petites colonies (SCVs). Chez B. cereus, ces SVCs se forment en réponse à l’exposition aux aminosides. Les SVCs croissent plus lentement que la forme originale de B. cereus. Ils ont une altération du métabolisme et sont résistants à ces antibiotiques qui ont déclenché cet état, à savoir les aminosides.

« La bactérie se protège contre les effets nocifs des antibiotiques en formant ces variants à petites colonies. Mais B. cereus est habituellement traité avec exactement ces antibiotiques qui induisent l’état de SCVs. Si un antibiotique déclenche la formation de SVCs, il déclenche également la résistance », explique le premier auteur Frenzel.

Repenser la thérapie et le diagnostic

Le mécanisme découvert par Frenzel, Kranzler et Ehling-Schulz est d’une énorme importance dans la pratique clinique. Les méthodes de diagnostic classique sont basées sur l’identification des caractéristiques métaboliques de B. cereus. Ces tests ne détectent pas les SVCs, car ils ont, un métabolisme altéré plus lent. Cela peut conduire à des thérapies antibiotiques incorrectes ou des diagnostics qui échouent. L’auteur de l’étude, Frenzel, pense que les diagnostics moléculaires sont la seule façon de diagnostiquer cette forme de B. cereus.

Traiter les infections à B. cereus en utilisant uniquement des aminosides pourrait entraîner le risque d’une infection prolongée. Les SVCs ont une croissance plus lente, mais ils continuent de produire des toxines qui sont dangereuses pour le corps. « Dans ce cas, une thérapie de combinaison avec d’autres groupes d’antibiotiques est conseillé », recommande Frenzel.

Nouveau mécanisme moléculaire de la formation des SVCs

Une espèce bactérienne qui a été connue pendant des années pour être un pathogène multi-résistant à l’hôpital et qui pose un risque vital pour les individus immunodéprimés, en particulier, est Staphylococcus aureus. Ces bactéries forment aussi des SVCs, mais contrairement à B. cereus ils sont capables de revenir à leur état d’origine. Pour B. cereus, l’adaptation à des variants à petites colonies semble être définitive. « Nous croyons que la formation de SCVs chez B. cereus fonctionne différemment que chez S. aureus », a dit un auteur de l’étude, Ehling Schulz.

Niche environnementale pour faire face au stress

« La capacité de former des SCVs semble être d’une importance environnementale chez les bactéries », croit Frenzel. « Ce mode de vie alternatif permet aux bactéries d’éviter des facteurs de stress menaçants tels que l’exposition aux antibiotiques. B. cereus vit dans le sol, et d’autres micro-organismes dans le sol produisent des antibiotiques. Ici aussi, la formation de SCVs serait un avantage pour les bactéries. »

Le gène MCR-1 détecté dans des isolats de dinde en Italie

15
jan
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Classé dans Contamination, Contamination croisée, Curiosité, E. coli, Environnement, Santé, Sécurité des aliments, Volaille.

Antibiotic-pill-300x200« Le gène MCR-1 détecté dans des isolats de dinde en Italie », source CIDRAP News.

L’Italie est le dernier pays à trouver le gène MCR-1 de résistance aux antibiotiques nouvellement identifié, selon une lettre de scientifiques italiens à ProMED Mail, le système de déclaration en ligne de l’International Society for Infectious Diseases.

Les résultats en provenance d’Italie sont des isolats de Escherichia coli obtenus à partir de dindes prélevées avant abattage en 2014, a écrit dans la lettre Antonio Battisti avec l’Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Lazio e della Toscana de Rome. Il a également noté que le séquençage du génome entier a révélé que l’isolat était également résistant à sept autres antibiotiques, indiquant une multirésistance.

Il a dit qu’une étude plus approfondie de la résistance à la colistine dans le secteur de la production animale italienne est en cours.

Jusqu’à présent, le gène, qui désactive la colistine, un antibiotique de dernière intention, a été retrouvé dans des prélèvements d’au moins 20 pays. Les chercheurs chinois l’ont rapporté dans le milieu du mois de novembre 2015, et depuis lors, des scientifiques ont recherché dans leurs collections de bactéries pour voir si des souches avaient le gène.

Une série d’études récentes suggèrent que le gène était présent depuis au moins une décennie et il s’est propagé dans plusieurs continents. Il est lié à l’utilisation d’antibiotiques dans la production d’animaux de boucherie.

Résistance à la colistine transférable retrouvée chez des bactéries d’animaux d’élevage en Allemagne

8
jan
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Classé dans Contamination, Contamination croisée, Curiosité, Environnement, Hygiène, Réglementation, Santé, Sécurité des aliments.

« Résistance à la colistine transférable retrouvée chez des bactéries d’animaux d’élevage en Allemagne », source BfR 01/2016 du 7 janvier 2016.

Antibiotic-pill-300x200Le BfR attire l’attention sur la transférabilité d’un gène de résistance en médecine humaine et vétérinaire

Les premiers résultats de surveillance de la résistance menée par l’Institut fédéral pour l’évaluation des risques (BfR) montrent que le gène transférable MCR-1 qui a été détecté pour la première en Chine et qui provoque une résistance à un antibiotique, la colistine, est également répandu parmi les bactéries intestinales d’animaux d’élevage en Allemagne. Le plus souvent, cette résistance à la colistine est détectée chez Escherichia coli lors de l’engraissement des volailles. Les gènes de résistance transférables peuvent être transmis à partir de bactéries intestinales inoffensives, que l’on appelle les bactéries commensales, à des pathogènes rendant ainsi ces pathogènes plus difficile à traiter. Il était précédemment supposé que la résistance à la colistine ne pouvait pas être transférée entre les bactéries. La proportion de bactéries résistantes à la colistine chez les animaux d’élevage en Allemagne n’a pas augmenté ces dernières années. Nos résultats montrent que cette résistance transférable aux antibiotiques est présente depuis de nombreuses années en Allemagne, mais elle a seulement été détectée récemment. Elle doit maintenant être étudiée pour savoir dans quelle mesure une telle résistance antimicrobienne transférable joue un rôle dans le traitement des maladies infectieuses chez l’homme. « Les résultats actuels soulignent que la stratégie d’une utilisation responsable des antibiotiques doit être poursuivie de manière cohérente à l’avenir », explique le Professeur Andreas Hensel, président du BfR. « Dans le cadre d’une approche à la santé, cette stratégie devrait englober tous les groupes de principes actifs en médecine vétérinaire et humaine. » D’autres investigations biomoléculaires sur le contexte génétique et le transfert potentiel sont actuellement menés afin d’évaluer les risques éventuels pour le consommateur.

NB : Traduction par mes soins. -aa

Des antibiotiques ouvrent la voie aux infections à C. difficile en tuant les bactéries bénéfiques modifiant les sels biliaires

7
jan
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Classé dans Contamination, Contamination croisée, Curiosité, Environnement, Hygiène, Microbiologie, Santé.

« Des antibiotiques ouvrent la voie aux infections à C. difficile en tuant les bactéries bénéfiques modifiant les sels biliaires », source ASM News du 6 janvier 2016.

CDiff_310Une nouvelle étude de la North Carolina State University et de l’Université du Michigan trouve que les sels biliaires (ou acides biliaires) qui sont altérés par des bactéries vivant normalement dans le gros intestin inhibent la croissance de Clostridium difficile ou C. difficile. C. difficile est une bactérie dangereuse qui peut causer des infections douloureuses et parfois mortelles. Le travail met en lumière les façons dont certains antibiotiques couramment utilisés peuvent promouvoir les infections à C. difficile en tuant des microbes modifiant les sels biliaires. Les travaux des chercheurs sont présentés dans le numéro du 6 janvier 2016 de mSphere, le nouveau journal en accès libre de l’American Society for Microbiology. La recherche a été financée par le National Institutes of Health.

C. difficile existe dans l’environnement sous forme de spore dormante. Pour coloniser l’intestin, les spores de C. difficile ont besoin de germer et de devenir bactéries en croissance, ce qui leur permet de produire des toxines et des dommages au gros intestin. Les chercheurs savent que l’utilisation de certains antibiotiques a conduit à un risque plus élevé d’infections à C. difficile, en particulier chez les patients hospitalisés. Casey Theriot, professeur en maladies infectieuses à la North Carolina State, University a voulu savoir exactement comment les spores de C. difficile interagissaient avec le microbiote ou l’environnement bactérien naturel, dans l’intestin.

« Nous savons que dans un environnement en bonne santé intestinale, la croissance de la bactérie C. difficile est inhibée », dit Theriot. « Mais nous avons voulu en savoir plus sur les mécanismes sous-jacents de cet effet inhibiteur. »

Les acides biliaires sont fabriqués à partir de cholestérol et aident à la digestion et à l’absorption des graisses. Ils contrôlent également le métabolisme des lipoprotéines, du glucose, des médicaments et de l’énergie. Les acides biliaires primaires sont fabriqués dans le foie et se déplacent à travers le tractus intestinal. Dans le gros intestin, les bactéries les transforment en acides biliaires secondaires, dont Theriot a trouvé qu’ils pourraient avoir un effet inhibiteur sur la croissance de C. difficile.

Theriot a lancé le projet avec un médecin chercheur de l’Université du Michigan en maladies infectieuses, Vincent Young et un chercheur de premier cycle Alison Bowman. Les chercheurs ont examiné le contenu intestinal de souris avant et après un traitement par de nombreux antibiotiques différents. Ils ont identifié 26 acides biliaires primaires et secondaires différents et ont défini les concentrations de ces acides, avant et après traitement. Puis ils ont ajouté des spores de C. difficile au contenu afin de savoir comment la bactérie peut germer et se développer dans un environnement intestinal réel.

Fait intéressant, ils ont constaté que les acides biliaires primaires dans l’intestin grêle ont permis aux spores de germer ou de commencer à se développer, indépendamment du traitement antibiotique.

Mais lorsque les spores atteignent le gros intestin, là où les bactéries intestinales normales produisent des acides biliaires secondaires, les chercheurs ont découvert que les acides biliaires secondaires ont stoppé la croissance de C. difficile. Lorsque ces bactéries, et les acides biliaires secondaires, n’étaient pas présents après traitement antibiotique, C. difficile a été capable de croître rapidement.

« Ces résultats sont une première étape pour comprendre comment le microbiote intestinal régule les acides biliaires dans l’intestin », explique Theriot. « Espérons qu’ils vont aider au développement de futures thérapies pour les infections à C. difficile et à d’autres troubles métaboliquement pertinents tels que l’obésité et le diabète. »

NB : L’article est disponible intégralement et gratuitement.

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