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Fondements de la stratégie pour lutter contre l’antibiorésistance, selon l’OIE

27
mai
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Classé dans Curiosité, Environnement, Hygiène, Santé, Sécurité des aliments.

À l’occasion de la 84e Session générale de l’Assemblée mondiale de ses délégués nationaux, l’OIE (Organisation mondiale de la santé animale) a présenté et proposé à adoption de ses membres les fondements de sa nouvelle stratégie pour lutter contre l’antibiorésistance. Source communiqué de presse du 24 mai 2016.

Extraits.

L’augmentation constatée ces dernières années de la fréquence et de l’étendue des résistances des bactéries aux antimicrobiens est aujourd’hui considérée par la communauté internationale comme un risque majeur nécessitant l’engagement de l’ensemble de la société. L’antibiorésistance est en effet un défi mettant en péril la santé humaine, la santé animale et également le bien-être animal.

imagesConsciente de l’enjeu majeur à relever pour les générations futures, l’OIE travaille depuis de nombreuses années sur le sujet notamment par l’élaboration de normes internationales dédiées et rénovées en 2015. L’OIE a de plus participé à l’élaboration et contribue à la mise en œuvre du plan d’action global contre l’antibiorésistance de l’OMS.

Mais ces initiatives internationales, bien qu’entérinées par les Pays membres des différentes organisations, ne pourront porter pleinement leurs fruits que si elles sont effectivement relayées de façon opérationnelle dans les pays.

Selon une étude de l’OIE, dans plus de 110 pays parmi les 130 interrogés, il n’existe pas de législation exhaustive et pertinente régissant les conditions d’importation, de fabrication, de distribution et d’utilisation des médicaments vétérinaires, antimicrobiens inclus. En conséquence, ces produits sont souvent en vente libre, et leur utilisation n’est pas encadrée par des professionnels de la santé animale. Le manque de contrôle de la qualité de ces produits est également très préoccupant : en effet, une enquête de 2012 montre que dans plus de 22 % des pays dotés d’une législation sur les médicaments vétérinaires, le contrôle qualité de ces derniers n’y avait pas été intégré.

La mise en œuvre des normes et recommandations internationales demande des efforts importants à l’échelle nationale, où les réalités de terrain sont parfois contraignantes, souvent du fait de l’absence de législation adaptée, du manque de moyens des Services vétérinaires et de l’existence de marchés parallèles hors du contrôle des autorités sanitaires.

C’est pourquoi, fidèle à ses valeurs de solidarité internationale, l’OIE a aujourd’hui présenté à ses Pays membres les fondements de sa stratégie pour les accompagner à l’échelon national, par étapes, afin de préparer le cadre législatif et de renforcer les capacités nécessaires pour une meilleure gestion de la problématique de l’antibiorésistance.

La mise en œuvre de cette stratégie permettra aux pays de bénéficier de l’ensemble des actions développées par l’OIE conformément à son mandat afin de mettre en œuvre les actions suivantes :

  • Règlementer la fabrication, la circulation et l’utilisation des antimicrobiens chez les animaux sur la base des normes internationales
  • Former les professionnels de la santé animale
  • Communiquer pour sensibiliser les acteurs
  • Mettre à disposition des produits de qualité et des alternatives à leur utilisation
  • Assurer la supervision par les vétérinaires de l’utilisation des antimicrobiens en santé animale pour un usage prudent et responsable
  • Surveiller les utilisations des antimicrobiens et le développement des résistances

Voir le rapport « Combattre la résistance aux agents antimicrobiens dans le cadre d’une approche “une seule santé”: les actions à mener et la stratégie de l’OIE ».

40 milliards de dollars pour lutter contre la résistance aux antibiotiques seraient nécessaires, selon un rapport britannique

21
mai
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Classé dans Contamination, Contamination croisée, Curiosité, Environnement, Hygiène, Microbiologie, Santé, Sécurité des aliments, Union Européenne.

« Le rapport d’un groupe britannique demande à 40 milliards de dollars pour lutter contre la résistance aux antibiotiques », source CIDRAP News.

Un rapport de l’UK Review on Antimicrobial Resistance (AMR) appelle à 10 interventions au niveau mondial pour répondre à l’utilisation abusive des antibiotiques et accroître les investissements dans de nouveaux médicaments et des thérapies alternatives qui auront un coût estimé de 40 milliards de dollars.

pills_with_moneyLe rapport, « Tackling Drug-Resistant Infections Globally: Final Report and Recommendations » ou « Lutte contre les infections résistantes aux antibiotiques à l’échelle mondiale : rapport final et recommandations », estime que les décès annuels attribuables aux infections résistantes aux antibiotiques vont augmenter à partir du des 700 000 actuellement à 10 millions d’ici 2050, si des mesures pour lutter contre la résistance aux antibiotiques ne sont pas prises immédiatement.

Le rapport indépendant sur la résistance des bactéries aux antibiotiques, qui a été commandé par le gouvernement britannique et le Wellcome Trust et présidé par l’économiste Jim O’Neill, secrétaire au trésor du Royaume-Uni, recommande dix interventions pour endiguer la demande pour les antibiotiques, tout en encourageant la recherche sur les traitements et les diagnostics qui répondent aux besoins médicaux cruciaux.

Les sept recommandations visant à réduire l’utilisation inutile des antimicrobiens sont :

  • Développer une campagne publique de sensibilisation mondiale
  • Amélioration de l’assainissement et la qualité de l’eau
  • Réglementer l’utilisation agricole des antibiotiques
  • Intensifier la surveillance de l’utilisation des antimicrobiens et des infections résistantes
  • Investir dans les méthodes de diagnostic rapide
  • Augmentation l’utilisation de vaccins disponibles et des thérapies alternatives
  • Attirer davantage de professionnels vers les domaines de la microbiologie et des maladies infectieuses

Les auteurs du rapport sur l’AMR ont également dit que la mise en œuvre d’un fonds mondial de l’innovation pour les traitements qui peuvent ne pas être commercialement attractifs et l’introduction d’incitations à investir dans les nouveaux antimicrobiens et l’amélioration des antimicrobiens sont deux étapes nécessaires pour accroître la fourniture d’antibiotiques efficaces.

La dixième recommandation, et la plus globale, faite par le rapport sur l’AMR appelle les Nations-Unies (ONU) et le G20 à former une coalition mondiale dédiée au pilotage des antibiotiques. Les auteurs du rapport estiment que les 10 programmes coûteront 40 milliards de dollars au cours des 10 prochaines années, une fraction des quelque 100 milliards de milliards de dollars perdue de la production mondiale en raison des infections résistantes aux médicaments qui sont prévues de se produire d’ici 2050.

Sensibilisation du public, soins préventifs

Les efforts pour enrayer l’utilisation inutile, gaspillée et souvent néfastes des antibiotiques critiques exigent d’éduquer le public sur l’utilisation appropriée des antimicrobiens, la prévention des infections pour lesquelles les antibiotiques sont prescrits, et le développement de tests de diagnostic qui peuvent éclairer le traitement pharmaceutique sur mesure, selon les auteurs.

La participation du public dans la diminution de la demande des antimicrobiens devrait être encouragée par le biais d’une campagne de sensibilisation publique mondiale, qui pourrait être financé par le mécénat d’entreprise lors de grands événements, le budget de la santé publique des pays à revenu élevé, et le soutien de programmes institutionnels dans les pays à revenu faible ou intermédiaire, ont dit les auteurs. Le public et les cliniciens doivent prendre conscience que l’utilisation d’antibiotiques appropriée devrait être soutenue par des normes pour un étiquetage clair des antibiotiques critiques et la restriction de la vente libre et sur Internet des produits antimicrobiens.

Les pays en développement assument actuellement une grande partie de la charge de la résistance croissante aux antibiotiques, et ensemble le traitement approprié et inapproprié des médicaments pourraient être évités par la prévention des infections virales, bactériennes et fongiques, ont écrit les experts.

« Les bases de la santé propre publique – de l’eau propre, une bonne hygiène et un bon nettoyage-désinfection et la prévention, la maîtrise et la surveillance des infections, sont aussi essentielles pour réduire l’impact de la résistance aux antimicrobiens comme elles le sont pour la maîtrise des maladies infectieuses », a déclaré Keiji Fukuda, représentant spécial du directeur général de l’AMR à l’Organisation mondiale de la santé et contributeur du rapport.

« Des mesures de maîtrise des infections dans les pays en développement impliquent la prévention vis-à-vis des maladies diarrhéiques, qui se traduit par l’utilisation annuelle de près de 500 millions de cours sur les antibiotiques dans quatre pays (Inde, Indonésie, Nigeria et Brésil), un nombre qui a amélioré la qualité de l’eau et de l’assainissement pourrait être réduit de 60% », selon le rapport.

Les infections nosocomiales sont l’un des principaux problèmes de la maîtrise des infections auxquels sont confrontés les pays développés, avec jusqu’à 10% de tous les patients hospitalisés contractant une infection, un taux qui monte à 33% pour tous les patients d’unités de soins intensifs. Partout dans le monde, une action clé pour prévenir les infections pour lesquelles les antibiotiques sont utilisés est le lavage simple et fréquent des mains, ont dit les auteurs.

L’utilisation agricole, le ruissellement environnemental

Aux États-Unis, plus de 70% des antibiotiques importants pour des besoins médicaux chez l’homme sont vendus pour une utilisation chez les animaux, ont dit les auteurs, et la responsabilité de résoudre ce problème doit être pris en charge par les pays du G20, qui produisent 80% des produits de viande mondiaux, note le rapport.

Les auteurs recommandent le développement d’ici à 2018 des objectifs mondiaux de 10 ans pour réduire l’utilisation des antibiotiques chez les animaux d’élevage, avec une surveillance accrue de l’utilisation des antimicrobiens et des pratiques d’élevage. En outre, l’utilisation agricole des antibiotiques de dernière intention qui traitent les infections critiques chez l’homme doit être arrêté d’urgence, et les producteurs d’aliments devraient être tenus de donner des informations aux consommateurs sur l’utilisation des antibiotiques chez les animaux.

La réduction agricole de l’utilisation des antimicrobiens exigera des pays pour réduire les coûts associés à la transition des agriculteurs à des pratiques durables de croissance des animaux et de prévention des maladies et développer des listes normalisées d’antibiotiques qui devraient être réservés à un usage médical humain, ont dit les auteurs. Les gouvernements devraient également développer des systèmes nationaux de surveillance pour surveiller la consommation d’antibiotiques et la résistance chez les personnes et les animaux.

Une question connexe concerne les émissions et la pollution de l’approvisionnement en eau causées par les fabricants de composés actifs pharmaceutiques. Les services réglementaires nationaux doivent fixer des normes minimales pour le traitement et le déversement de déchets ayant des propriétés antimicrobiennes et encourager des normes environnementales plus élevées dans l’industrie pharmaceutique, ont dit les auteurs. Le rapport sur l’AMR estime que traiter ce problème croissant des antibiotiques dans la fourniture d’eau va coûter 180 millions de dollars par an pour traiter 30 000 à 70 000 tonnes de déchets antimicrobiens.

Développer la recherche pas assez financée

Une question importante affectant la surprescription d’antibiotiques pour des infections non-bactériennes ou de maladies bactériennes où le traitement antimicrobien est mal avisé est le manque de tests de diagnostic rapide. Aux États-Unis seulement, 27 millions des 40 millions de personnes en quête de soins pour des problèmes respiratoires chaque année reçoivent une prescription inutile d’antibiotiques, ou près de 70%, selon les auteurs.

Le développement de nouvelles technologies de diagnostic pourrait être stimulée dans les pays à faible revenu et à revenu intermédiaire par un stimulus commercialement viable sur le marché qui offre des incitations pour les achats de diagnostic et encourage la recherche sur les méthodes de test rapide et précis. Les pays riches devraient exiger que toutes les ordonnances d’antibiotiques soient faites après un résultat de test, ont dit les auteurs.

Bien que l’introduction de nouveaux tests coûterait 500 000 millions à 1milliard de dollars par an, les auteurs disent que le diagnostic rapide pourrait avoir des résultats sur la résistance aux antibiotiques similaires aux effets monumentaux réalisés par l’amélioration de la couverture vaccinale mondiale au début des années 2000 de Gavi, l’Alliance du vaccin.

En plus des avantages offerts par des diagnostics rapides et/ou au niveau des centres de soins, les vaccins et le traitement alternatif pour les infections bactériennes pourraient être utilisées plus largement, ont dit les auteurs. Le rapport sur l’AMR note que la couverture universelle des vaccins conjugués contre le pneumocoque pourrait réduire de 47% la quantité d’antibiotiques prescrits pour une pneumonie causée par Streptococcus pneumoniae.

Les agences nationales devraient également encourager la recherche à un stade précoce sur les thérapies alternatives (non-antibiotiques) qui ciblent les bactéries pathogènes. Les traitements prometteurs comprennent la thérapie par les phages (virus qui tuent les bactéries), la thérapie enzymatique avec la lysine, les anticorps qui limitent la pathogénicité des bactéries, la stimulation immunitaire et le traitement par des peptides, ont dit les auteurs.

Un problème lié à l’amélioration des soins et le traitement clinique est lié à la pénurie mondiale de microbiologistes et de cliniciens spécialisés dans les maladies infectieuses. Le rapport a révélé que les médecins en maladies infectieuses aux États-Unis ont reçu des salaires inférieurs par rapport aux 24 autres spécialités médicales.

Si les hôpitaux, les laboratoires, les gouvernements et l’industrie privé veulent faire des progrès dans la lutte contre la résistance aux antimicrobiens, ils doivent récompenser les professionnels qui se focalisent sur les antibiotiques et la recherche avec des salaires plus élevés, des incitations éducatives et le prestige, ont dit les auteurs.

Dans un commentaire paru dans The Lancet Infectious Diseases, Laura J.V. Piddock, de l’Institut de microbiologie et des maladies infectieuses à l’Université Birmingham au Royaume-Uni, a écrit que les professionnels entrant en microbiologie et dans la recherche sur les maladies infectieuses ont subi les effets du sous-financement depuis des années, conduisant à un épuisement des compétences dans des domaines clés de la recherche. Le manque d’investissement se traduit par des difficultés à avoir des médicaments en évolution qui traitent des infections résistantes, telles que celles causées par des bactéries Gram négatifs, du laboratoire aux établissements de santé.

« Les travaux de l’équipe de l’AMR rendent éminemment clairs que globalement la crise de la résistance aux antimicrobien éclipse les récentes menaces de plusieurs ordres de grandeur », a déclaré Piddock.

Accroître l’offre des antibiotiques

L’utilisation d’antibiotiques inapproprié et inutile contribue de manière significative à la résistance, soulignent les experts, mais pour les nombreux antibiotiques qui cessent de traiter des infections efficacement, peu existe pour prendre leur place. Les auteurs du rapport sur l’AMR avertissent que si aucun nouveau médicament n’est développé sur les infections résistantes d’ici 2050, nous allons revenir à une époque où même les procédures de soins de santé les plus courants seront entreprises avec de grands risques.

L’attention mondiale s’est tournée récemment vers ce besoin urgent, avec 375 millions de dollars pour la surveillance des infections résistantes aux antibiotiques dans les pays à faible revenu et à revenu moyen consacré l’année dernière par Fleming Fund au Royaume-Uni, 144 millions de dollars au total versé par le Royaume-Uni et la Chine pour lancer une recherche dans de nouveaux médicaments et des diagnostics, des initiatives européennes pour le développement d’antibiotiques novateurs, et des efforts des États-Unis de la part de la Biomedical Advanced Research and Development Authority (BARDA).

En dépit de ces programmes en cours, le développement de nouveaux antibiotiques et des usages innovants pour les anciens médicaments reste sous-financé, commercialement non viable et sans attrait pour les investisseurs, ont dit les auteurs. Sur les 40 milliards de dollars de ventes annuelles d’antibiotiques à l’échelle mondiale, seuls 4,7 milliards de dollars va vers des médicaments brevetés. Pour résoudre ce problème, le rapport propose un fonds d’innovation mondiale de 2 milliards de dollars dans la recherche et le développement de nouveaux antimicrobiens à un stade précoce au cours des 5 prochaines années.

En plus d’un fonds mondial, le rapport demande que les gouvernements créent des incitations pour le développement de nouveaux médicaments, dont l’accès au marché de récompenses d’environ 1 milliard de dollars par médicament, avec un accent vers des traitements innovants pour les infections résistantes causées par la tuberculose, la gonorrhée et les bactéries Gram négatifs, ont dit les auteurs. Idéalement, les fabricants seraient poussés à développer 15 nouveaux antibiotiques chaque décennie, avec au moins 4 médicaments qui ciblent les bactéries qui menacent le plus médicalement.

La coordination mondiale, l’investissement

Les auteurs recommandent que l’ONU et le G20 construisent une coalition mondiale afin de consacrer des fonds et une attention réglementaire aux initiatives recommandées dans le rapport. Ils ont dit que les étapes les plus cruciales sont de développer une campagne mondiale de sensibilisation du public, la création de récompenses l’entrée de nouveaux médicaments sur le marché, de stimuler le développement de meilleurs diagnostics et de réduire l’utilisation d’antibiotiques en agriculture.

« Ce qui est certain est qu’aucun pays ne peut résoudre le problème des bactéries résistantes aux antibiotiques lui-même et plusieurs de nos solutions proposées doit requérir au moins une masse critique de pays derrière eux, si l’on veut faire une différence », selon les auteurs.

Le budget de 40 milliards de dollars proposé se décompose en 16 milliards de dollars pour la recherche et le financement du développement de nouveaux médicaments au cours des 10 prochaines années, 2 milliards dollars alloués à un Fonds mondial d’innovation sur 5 ans, 1 milliard à 2 milliards de dollars consacré à de nouveaux diagnostics et des vaccins chaque année, et de 40 millions à 100 de dollars par an consacrés à la sensibilisation et à l’éducation du public.

Les méthodes recommandées pour répondre aux besoins économiques comprennent l’imposition d’une taxe sur les sociétés pharmaceutiques qui ne parviennent pas à investir dans le développement des antibiotiques, une taxation des antimicrobiens ou la distribution de bonus pour récompenser les efforts novateurs en recherche.

Bien que les coûts pour faire face à la résistance aux antimicrobiens est de plus en plus importante et que les interventions représentent des changements importants dans les pratiques agricoles, médicales et industrielles des pays, une action immédiate est nécessaire, ont dit les auteurs, ajoutant : « En 2050, le nombre de décès pourrait atteindre le chiffre énorme d’une personne toutes les trois secondes, si on ne s’attaque pas à la résistance aux antimicrobiens aujourd’hui. »

« La lutte contre la résistance aux antibiotiques est au cœur du développement économique à long terme des pays et notre bien-être. Des solutions pour y faire face doivent concernées au premier lieu les centres de santé et ils doivent nous aider à faire cesser de gaspiller des médicaments dont nous dépendons et qui sont pourtant épuisables », disent les auteurs.

Un antibiotique à spectre étroit tue des pathogènes sans tuer les bonnes bactéries

10
mai
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Classé dans Contamination, Curiosité, Environnement, Santé.

« Des antibiotiques à spectre étroit tuent des pathogènes sans tuer les bonnes bactéries », source ASM News.

Le problème des antibiotiques à large spectre est qu’ils tuent les bonnes bactéries ainsi que les méchantes. Mais un nouvel antibiotique, Debio 1452, qui est étroitement ciblé sur des pathogènes de type Staphylococcus, n’a causé presque pas de dégât au microbiome intestinal chez un modèle de souris, alors que les antibiotiques conventionnels à large spectre ont causé des dommages majeurs. L’étude est publiée avant impression le 9 mai dans Antimicrobial Agents and Chemotherapy, une revue de l’American Society for Microbiology.

MicrobiomeDans l’étude, les chercheurs ont traité des groupes de cinq souris avec soit Debio 1452 ou l’un des différents antibiotiques à large spectre couramment utilisés, a dit l’auteur correspondant Charles O. Rock, Directeur de la Protein Production Facility dans le Infectious Diseases Department, St. Jude Children’s Research Hospital, Memphis, Tennessee. Le traitement a duré 10 jours, suivi d’une période de récupération de 27 jours, au cours de laquelle les fèces – représentant le microbiome intestinal – ont été recueillis pour analyser la diversité et l’abondance des espèces bactériennes. Les chercheurs ont utilisé la prochaine technologie de séquençage de nouvelle génération pour identifier les espèces bactériennes, et la PCR en temps réel pour déterminer l’abondance.

L’abondance et la diversité sont restées pratiquement stables sous traitement par Debio 1452. En revanche, « le traitement par le linézolide, la clindamycine et l’amoxicilline à causé une diminution ~4000 fois de l’abondance bactérienne de l’intestin au deuxième jour de traitement qui a persisté jusqu’à la fin du traitement », selon l’article. (la moxifloxacine a causé une réduction beaucoup plus petite, mais toujours significative dans la réduction de l’abondance, et la récupération a été beaucoup plus rapide.) En outre, des changements majeurs dans la composition des espèces du microbiome intestinal se sont produits pendant le traitement avec des antibiotiques à large spectre, a déclaré Rock.

« Ces résultats démontrent que l’approche sélective du pathogène lors du développement des antibiotiques est un moyen efficace pour réduire au minimum les dommages collatéraux au microbiome », a dit Rock.

Justifiant la recherche, Rock a dit que « Les patients du St. Jude Children’s Research Hospital ont souvent un traitement antibiotique prolongé au cours de leur traitement contre le cancer. Les enfants avec un système immunitaire en développement et les patients avec un traitement antibiotique sur le long terme sont les plus vulnérables aux conséquences négatives découlant d’un microbiome intestinal dévasté. »

« Les traitements antibiotiques à large spectre à sauvent d’innombrables vies chaque année, mais contribuent également aux fléaux modernes des maladies métaboliques et auto-immunes », a dit Rock. « Notre recherche montre qu’une approche sélective des pathogènes aux résultats du développement d’antibiotiques qui combattent les infections bactériennes sans promouvoir ces effets secondaires indésirables. »

Estimer la menace des bactéries résistantes aux antibiotiques liées à l’agriculture pose un énorme défi

29
avr
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Classé dans Contamination, Contamination croisée, Curiosité, Environnement, Hygiène, Microbiologie, Santé, Sécurité des aliments, Viande, Volaille.

« Estimer la menace des bactéries résistantes aux antibiotiques liées à l’agriculture pose un énorme défi », source CIDRAP News.

Le rôle de l’agriculture en tant que source de bactéries résistantes aux antibiotiques (BRAs) qui peuvent constituer une menace pour les humains est si complexe et si mal compris qu’une analyse fiable des risques est presque impossible à l’heure actuelle, selon un article récent paru dans mBio*. Mais les auteurs suggèrent qu’un programme de suivi normalisé se concentrant sur un petit nombre d’espèces bactériennes et de gènes de résistance pourrait commencer à combler les lacunes.

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USDA / Scott Bauer

L’article réalisé par des chercheurs suisses et irlandais, publié le 19 avril, souligne que l’aliment n’est pas le seul véhicule par lequel les bactéries résistantes issues de sources agricoles peuvent atteindre les personnes. Il dit aussi que le partage fréquent des gènes de résistance entre les différentes espèces bactériennes pose un grand défi dans la compréhension de la propagation des BRAs dans l’agriculture, et le problème est aggravé par l’utilisation de méthodes de recherche « non comparables ».

Les auteurs ont utilisé les données disponibles en Suisse, avec des laboratoires ayant une longue surveillance établie, afin d’évaluer les connaissances actuelles sur les pathogènes résistants aux antibiotiques dans l’agriculture et la contribution de l’industrie à la menace globale de la résistance.

Utilisation préventive autorisée

En Suisse, les antibiotiques peuvent être utilisés dans l’alimentation animale et l’eau potable par prescription à des fins préventives, bien que l’utilisation de médicaments pour promouvoir la croissance soit interdite depuis 1999, indique l’article. En 2014, 49 250 kilogrammes d’antibiotiques ont été vendus pour un usage vétérinaire dans le pays.

Depuis 2006, les laboratoires de l’État ont analysé des bactéries « indicatrices » chez le poulet, le porc et les bovins pour la résistance. Le suivi a montré qu’en 2014, 6,9% des prélèvements réalisés de viande de poulets de chair avaient des Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline, et 73,3% avaient des Escherichia coli des bêta-lactamases à spectre étendu ou bêta-lactamases AmpC.

Alors que les prélèvements de viande en Suisse sont testés pour les antibiotiques et les bactéries résistantes aux antibiotiques, le fumier ne l’est pas. Ceci est une préoccupation, disent les chercheurs, parce qu’une grande partie des antibiotiques sont encore actifs après qu’ils soient excrétés. Par conséquent, le fumier est un « hot spot » pour les bactéries qui hébergent des gènes de résistance aux antibiotiques (GRAs) qui résident sur des éléments génétiques mobiles (EGMs). Lorsque le fumier est utilisé pour traiter le sol, les antibiotiques et les GRAs suivent, et ils peuvent être transmis à aux bactéries du sol.

« La pollution de l’environnement » par des antimicrobiens et les GRAs augmente probablement le risque que des bactéries inoffensives et des pathogènes humains acquièrent une résistance par des EGMs qui facilitent le transfert de gènes entre les espèces bactériennes lointainement connexes, selon les chercheurs.

Ils ont dit que l’introduction d’agents antimicrobiens et des GRAs dans le sol signifie qu’ils peuvent être absorbés par les plantes par l’eau et par absorption passive. Plusieurs études ont détecté des bactéries résistantes sur des légumes ou des fruits, mais trop peu de données sont disponibles pour établir une relation entre l’eau d’irrigation ou le fumier contenant des bactéries résistantes ou des GRAs et leur présence sur les produits.

L’article constate en outre qu’il n’y a pas de système de surveillance des voies de transmission complexes des agents antimicrobiens (AAM), des GRAs et des BRAs du fumier au sol, à l’eau, aux végétaux et chez l’homme. « Cette situation est particulièrement préoccupante, car le fumier et les stations d’épuration sont des réservoirs de résistance aux antibiotiques et pourraient être utilisés comme points critiques pour la maîtrise, où la libération de mélanges complexes d’AAM, de GRAs, et de BRAs de la ferme et des alentours urbains à l’environnement pourrait être maîtrisé ».

Les échanges de gènes sont insaisissables

La réalité est que les gens sont exposés aux bactéries résistantes aux antibiotiques d’origine animale, non seulement à travers les aliments, mais aussi grâce à la libération de GRAs dans l’environnement et cela fait que c’est un défi scientifique difficile, selon les chercheurs. « Les multiples voies d’échange des gènes ont jusqu’à présent défait les tentatives de suivre les mouvements de façon qualitative ou quantitative de ces gènes in vivo. »

Mis à part les bactéries zoonotiques, de tels transferts de gènes rendent moins probable que les mêmes hôtes bactériens soient retrouvés chez les animaux et les humains et plus probablement que seuls les gènes résistants seront identifiables chez les pathogènes qui infectent les humains, selon les chercheurs. Et les gènes peuvent être modifiés quand ils sautent entre les hôtes. « Ainsi, il est important que les programmes de surveillance se concentrent non seulement sur les bactéries pathogènes résistantes aux antibiotiques mais aussi déterminer les bactéries résistantes aux antibiotiques ainsi que les GRAs qu’elles hébergent. »

D’un autre côté, certains outils de recherche les plus récents devraient aider les scientifiques à relever le défi du suivi des GRAs dans l’environnement, notent les auteurs. Ceux-ci comprennent des puces de détection des gènes, qui ont réduit le coût du dépistage des prélèvements pour des centaines de gènes de résistance, ainsi que la métagénomique et le séquençage de nouvelle génération, qui permettent de détecter des millions de gènes dans un échantillon d’ADN, selon les auteurs.

Trop d’inconnues pour une analyse des risques

Mais les auteurs ont présenté une longue liste de lacunes dans les connaissances concernant la résistance aux antibiotiques dans l’agriculture. « Avec les lacunes de nos données et l’utilisation de méthodologies non comparables, actuellement, il est presque impossible de développer une analyse des risques fondée sur une situation réelle », écrivent-ils.

L’article décrit six étapes nécessaires pour comprendre l’épidémiologie de la sélection et la transmission de la résistance. Les exemples incluent la définition des points critiques pour leur maîtrise où les interventions peuvent faire une différence, développant et mesurant les effets des stratégies de prévention, et l’étude de la prévalence de la résistance chez les bactéries commensales du bétail qui consomment des aliments contaminés par les BRAs.

Pour commencer à traiter les énormes lacunes dans les données, les auteurs suggèrent un programme de surveillance volontaire qui mettrait l’accent sur deux espèces, E coli et Pseudomonas aeruginosa, et trois gènes de résistance spécifiques (tet[M], aph et blaCTX-M) qui couvrent trois importantes classes d’antibiotiques et qui ont été détectés dans l’environnement, et les microbiomes des animaux et des humains.

« Un programme simple de surveillance mondial des sols, des plantes, des animaux, de l’eau, et [des usines de traitement des eaux usées] en utilisant les mêmes méthodes pourraient créer la plus grande base de données de connaissances sur la résistance aux antibiotiques et pourrait être utilisé pour générer des analyses de risques des différents compartiments écologiques », écrivent les chercheurs.

En attendant, les efforts pour lutter contre la résistance liée à l’agriculture devraient inclure la prévention de flux génique vers et à partir des réservoirs environnementaux de résistance, car il existe des preuves que les GRAs environnementaux peuvent être transférées à des pathogènes, selon les chercheurs. Cela signifie qu’en limitant les sources agricoles de résistance et en trouvant des méthodes efficaces pour gérer le fumier, les foyers domestiques, les hôpitaux et les eaux usées industrielles contenant des antibiotiques et des GRAs.

* L’article est disponible intégralement et gratuitement.

Accroissement des Escherichia coli producteurs de shigatoxines avec l’utilisation d’antibiotiques promoteurs de croissance chez les bovins

24
avr
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Classé dans Contamination, Curiosité, E. coli, Environnement, Hygiène, Réglementation, Santé, Sécurité des aliments.

Cette étude chinoise vient de paraître dans le dernier numéro de Emerging Infectious Diseases.

Cow-Whisperer-by-Caese1Résumé.

Les antibiotiques sont couramment utilisés chez des animaux producteurs de denrées alimentaires pour promouvoir la croissance et prévenir des maladies infectieuses. Nous avons étudié les effets des antibiotiques promoteurs de croissance chez les bovins (bAGPs ou bovine antibiotic growth promoters) sur la propagation et la diffusion de shigatoxines (Stx) codées par des phages (ou propages –aa) chez Escherichia coli. La co-culture de E. coli O157:H7 et d’autres E. coli isolés chez des bovins en présence de concentrations sublétales de bAGPs a augmenté de manière significative l’apparition de E. coli producteurs de shigatoxines non-O157 en induisant une réponse du système SOS chez E. coli O157:H7. La médiation de la plus importante de la transmission des phages Stx a été induite par l’oxytétracycline et la chlortétracycline, qui sont couramment utilisés en élevage. Les bAGPs peuvent donc contribuer à l’expansion des E. coli pathogènes producteurs de shigatoxines.

Les auteurs terminent leur article en indiquant :

dans cette étude, nous avons démontré que des bAGPs, en particulier la chlortétracycline et l’oxytétracycline, sont impliqués dans la diversification des sérotypes O de E. coli stx-positif en facilitant le transfert horizontal des phages Stx même à des concentrations sensiblement faibles. Ainsi, l’utilisation de ces agents pourrait conduire à l’émergence de E. coli pathogènes.

NB : Rappelons que l’utilisation des antibiotiques comme promoteurs de croissance est bannie en Europe depuis janvier 2006.