Visiter Processalimentaire.com
Contacter le magazine
S'abonner en ligne | S'inscrire à l'e-news


Des gants contaminés augmentent le risque de transmission croisée de pathogènes responsables d’infections nosocomiales

20
juin
Aucun commentaire
Classé dans Contamination, Contamination croisée, Curiosité, Environnement, Hygiène, Santé, Sécurité des aliments.

« Des gants contaminés augmentent le risque de transmission croisée de pathogènes responsables d’infections nosocomiales », source ASM Microbe 2016.

L’étude présentée au meeting de recherche ASM Microbe 2016 fournit une preuve claire que les gants des personnels de santé contaminent les surfaces hospitalières avec des bactéries. Les données des chercheurs suggèrent également que les types de bactéries peuvent influer sur les taux de transmission croisée entre les gants et les surfaces des hôpitaux contaminés.

gloves« La maîtrise des infections est une priorité pour tous les hôpitaux afin de réduire la propagation des infections nosocomiales », a déclaré l’auteur de l’étude, Sae Otani, étudiante en maîtrise à la Bunkyo Gakuin Uinversity. « Le port des gants est recommandé comme une barrière de protection pour les personnels de santé afin de réduire le risque de contamination pendant le contact avec une expectoration, l’urine et des fluides corporels infectieux », a-t-elle dit. Toutefois, le fait de modifier ou de retirer des gants contaminés comporte un risque élevé de transmission de pathogènes associés au soins de santé.

Les chercheurs, dirigés par Sae Otani et Kazue Fujita de la Nippon Medical School, ont utilisé des pathogènes communs responsables d’infections nosocomiales dans cette étude. Les gants d’examen en nitrile ont été inoculés avec des micro-organismes spécifiques. Après inoculation des bactéries, des gants contaminés ont touchés une surface stérilisée en polypropylène. Ensuite, le nombre de bactéries viables sur la surface en polypropylène a été quantifiée.

Acinetobacter baumannii est resté à la surface en polypropylène. En revanche, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae et Pseudomonas aeruginosa n’ont pas été détectés sur la surface en polypropylène. La sensibilité aux antibiotiques des bactéries n’a eu aucun effet notable sur la survie sur la surface en polypropylène.

« Cette étude montre que les gants contaminés augmentent le risque de transmission croisée des pathogènes responsables d’infections nosocomiales chez les personnels de santé et dans l’environnement », a déclaré Mme Otani. En outre, les données suggèrent également que les types de bactéries peuvent influer sur le taux de transmission croisée entre les gants et les surfaces contaminées des hôpitaux. A. baumannii présentent un risque plus élevé de transmission des gants aux surfaces hospitalières que E. coli, K. pneumoniae et P. aeruginosa dans cette étude. Les infections nosocomiales causées par des micro-organismes gram-négatifs tels que Acinetobacter spp., P. aeruginosa et Enterobacteriaceae sont une préoccupation majeure.

« L’utilisation correcte des gants peut diminuer le risque d’infections nosocomiales et des gants doivent être soigneusement utilisés et retirés après utilisation en fonction des types de bactéries », a déclaré Mme Otani.

Sae Otani, Université Bunkyo Gakuin, Kazue Fujita, Nippon Medical School et ses collègues ont présenté leurs résultats à la session de diapositives de l’ASM Microbe 2016 à Boston dimanche soir 19 juin 2016.

NB : On connaissait le rôle de faux ami des gants en alimentaire avec la quasi absence de lavage des mains entre chaque changement de gants, nous voilà désormais informé sur certaines pratiques dans des hôpitaux …

Etats-unis : Profils des gènes de virulence et relations clonales d’isolats de E. coli O26:H11 provenant de bovins déterminés par séquençage du génome entier

15
juin
Aucun commentaire
Classé dans Contamination, Contamination croisée, Curiosité, E. coli, Environnement, Hygiène, Microbiologie, Sécurité, Sécurité des aliments, TIAC, Viande.

Résumé.

ehec-hygiene-19844747Escherichia coli O26 est le second plus important sérotype de E. coli entérohémorragique (EHEC) dans le monde entier. Les souches du sérotype O26 sont classés principalement en deux groupes : les E. coli entéropathogènes (EPEC) O26, portant un locus d’effacement des entérocytes (LEE) et causant la plupart du temps des diarrhées modérées et les E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) O26, qui porte le gène (stx), responsable de conséquences plus graves. Les souches O26 stx-négatif peuvent être divisées en deux groupes complémentaires. Un groupe O26 diffère significativement des EHEC O26, tandis que l’autre, le groupe EHEC-like O26 montre toutes les caractéristiques des EHEC O26 sauf la production de shigatoxines. De façon à déterminer les différentes populations de E. coli O26 présents, chez les troupeaux de bovins américains, nous avons séquencé 42 souches O26:H11 isolées de bovins d’engraissement et les avons comparés à 37 génomes de O26:H11 génomes disponibles dans la GenBank. L’analyse phylogénétique de l’ensemble du génome entier par un typage par séquençage multilocus (wgMLST pour whole-genome multilocus sequence typing) a montré que les souches O26:H11/H chez les bovins américains avaient une diversité élevée. La plupart des souches avait une séquence type 29 (ST29). Par wgMLST, deux lignées claires pouvaient être distinguées parmi les bovins. La lignée 1 consistait en des souches de EHEC-like O26:H11 (ST29) (4 souches) et des souches de EHEC O26:H11 (ST21) (2 souches) et la lignée 2 (36 souches) consistaient en des souches de EPEC O26:H11 (ST29). Dans l’ensemble, notre analyse a montré que les bovins américains hébergeaient des souches pathogènes de E. coli (ST21 ; stx1+ ehxA+ toxB+) et également des souches de E. coli O26:H11 potentiellement pathogènes (ST29 ; ehxA+ toxB+). En outre, l’analyse in silico a montré que 70% des bovins hébergeaient des souches ayant au moins un gène de résistance aux antibiotiques. Nos résultats ont montré que l’analyse de la séquence du génome entier est une approche solide et valable pour caractériser génétiquement E. coli O26:H11, qui est d’importance pour la sécurité des aliments et la santé publique.

Référence. Gonzalez-Escalona N, Toro M, Rump LV, Cao G, Nagaraja TG, Meng J. 2016. Virulence gene profiles and clonal relationships of Escherichia coli O26:H11 isolates from feedlot cattle as determined by whole-genome sequencing. Appl Environ Microbiol 82:3900–3912. doi:10.1128/AEM.00498-16.

Profil moléculaire de STEC et de EPEC isolés d’environnements côtiers en France

15
juin
Aucun commentaire
Classé dans Contamination, Contamination croisée, Curiosité, E. coli, Environnement, Microbiologie, Réglementation, Santé, Sécurité des aliments, TIAC.

Résumé.

Ecoliarrows_320x175Les souches de Escherichia coli producteurs de shigatoxines (STEC) et de E. coli entéropathogènes (EPEC) peuvent être responsables d’infections d’origine alimentaire chez l’homme. Vingt-huit souches de STEC et 75 souches de EPEC ont été isolé précédemment de crustacés dans des zones françaises de récolte et leurs bassins versants et appartenant à 68 sérotypes distinguables ont été caractérisées dans cette étude. La PCR en temps réel à haut débit a été utilisée pour rechercher chez 75 E. coli la présence de gènes cibles associés à la virulence et des gènes codant pour les shigatoxines (stx) et intimine (eae) et elles ont été sous-typées en utilisant respectivement des tests par PCR et le séquençage de l’ADN. Les résultats ont montré un niveau élevé de diversité entre les souches, avec 17 profils uniques de gènes de virulence pour les STEC et 56 pour les EPEC. Sept souches de STEC et 15 souches de EPEC ont été retrouvés présenter un grand nombre ou une combinaison particulière de marqueurs génétiques de virulence et la présence de variants stx et/ou eae, suggérant leur pathogénicité potentielle chez l’homme. Parmi celle-ci, une souche O26:H11 stx1a eae-β1 a été associée à un grand nombre de gènes associés à la virulence (n = 47), comprenant des gènes hébergeant sur le locus d’effacement des entérocytes (LEE) ou d’autres îlots de pathogénicité, tels que OI-122, OI-71, OI-43/48, OI-50, OI-57, et l’île de haute pathogénicité (HPI). Un souche de STEC O91:H21 contenant variants stx (stx1a, stx2a, stx2c et stx2d) a été retrouvé posséder des gènes associés à la pathogénicité des îlots OI-122, OI-43/48 et OI-15. Parmi les souches EPEC hébergeant des gènes de virulence d’un grand nombre (n, 34 à 50), huit appartenaient au sérotype O26:H11, O103:H2, O103:H25, O145:H28, O157:H7 ou O153:H2.

Importance. L’espèce E. coli comprend une grande variété de souches, dont certaines qui sont responsables d’infections graves. Cette étude, une évaluation moléculaire des risques souches d’évaluation des risques de souches de E. coli isolées à partir de l’environnement côtier, a été conduite afin d’évaluer le risque potentiel pour les consommateurs de coquillages. L’étude décrit la caractérisation des profils des gènes de virulence et les et le polymorphisme des isolats de E. coli stx/eae et souligne clairement que la majorité des souches isolées du milieu côtier sont potentiellement faiblement pathogènes, tandis que d’autres sont susceptibles d’être plus pathogènes.

Référence. Balière C, Rincé A, Delannoy S, Fach P, Gourmelon M. 2016. Molecular profiling of Shiga toxin-producing Escherichia coli and enteropathogenic E. coli strains isolated from French coastal environments. Appl Environ Microbiol 82:3913–3927. doi:10.1128/AEM.00271-16.

Le séquençage du génome entier va-t-il faire augmenter les litiges en termes de sécurité des aliments ?

11
juin
Aucun commentaire
Classé dans Contamination, Contamination croisée, Curiosité, Environnement, HACCP, Hygiène, Microbiologie, Réglementation, Santé, Sécurité des aliments, TIAC.

« Détection génétique des germes : de nouvelles analyses vont entraîner des litiges liés aux maladies d’origine alimentaire », par Steven M. Sellers, Bloomberg BNA.

Les contentieux liés aux éclosions de maladies d’origine alimentaire seront de plus en plus influencés par le profilage génétique des pathogènes et les nouvelles règles fédérales de sécurité des aliments, ont dit à Bloomberg BNA des avocats expérimentés en sécurité des aliments.

CDC-illustration-WGSUn nouveau test génétique pour les bactéries et les virus mis en œuvre par le Centers for Disease Control and Prevention informe précisément les victimes d’éclosions de maladies d’origine alimentaire vers une source de contamination en utilisant l’ADN du pathogène comme guide.

Le nouveau test, connu sous le nom de séquençage du génome entier, promet de mieux suivre et d’identifier les 48 millions de maladies d’origine alimentaire qui se produisent chaque année aux Etats-Unis, en particulier celles qui déclenchent des éclosions dans plusieurs États.

Cette avancée scientifique sera renforcée par des analyses alimentaires et d’autres mesures indiquées dans la Loi sur la modernisation de la sécurité des aliments de la FDA, une loi fédérale conçue pour changer l’attention nationale afin de répondre à une contamination des aliments en la prévenant.

(…)

Les développements peuvent améliorer la sécurité des aliments dans le pays, mais ils peuvent aussi travailler à renforcer le témoignage des plaignants et des litiges liés à des décès injustifiés dans des éclosions de maladies d’origine alimentaire qui se produisent, disent des avocats.

Il reste à voir si la science et ces règles peuvent affecter les litiges en cours de maladies d’origine alimentaire contre Chipotle Mexican Grill Inc., Blue Bell Creameries Inc., Dole Vegetables Inc. et d’autres producteurs alimentaires majeurs.

« Un grand nombre de fois nous ne pouvions pas retrouver le coupable (pathogène) », a dit récemment l’avocat de plaignants, Fred Pritzker de Pritzker Olsen de Minneapolis.

« Nous ne savions pas d’où venait le pathogène », a dit Pritzker, qui a plaidé dans de nombreux cas d’éclosions de maladies d’origine alimentaire dans plusieurs États. « Comme les outils deviennent plus sophistiqués et raffinés, il est plus facile de relier les cas ensemble et de retrouver une source commune. C’est une grande avancée. »

Le séquençage du génome entier (SGE) est une grande amélioration par rapport à la technologie existante actuellement utilisée par les services réglementaires fédéraux dans les investigations sur les éclosions. La PFGE est connue, mais le SGE actuel prend un instantané plus étroit du pathogène.

« La PFGE serait comme prendre un puzzle avec une centaine de pièces et vous avez deux qui correspondent », a dit l’avocate Sarah Brew de Faegre Baker Daniels de Minneapolis.

Mais le séquençage du génome entier, dit-elle, « est comme le puzzle entier mis en place avec toutes les pièces. »

« Le CDC le décrit comme étant comparable à des jumeaux identiques, avec ce niveau d’assurance », a déclaré Brew. « On peut aller en arrière et regarder des cas passés il y a quatre ou cinq ans, même sans faire d’épidémiologie classique afin de demander aux gens ce qu’ils ont mangé », a-t-elle dit.

(…)

Et l’utilisation par le gouvernement du nouveau test génétique dans les éclosions de maladies d’origine alimentaire est en pleine expansion, a dit William Marler, de Marler Clark de Seattle.

« En ce moment, la FDA, le Food Safety Inspection Service de l’USDA et le CDC l’utilisent dans les cas de listériose, et je suis allé à une séries de conférences où ils ont dit qu’ils allaient commencer à l’utiliser pour Salmonella, E. coli et d’autres pathogènes », a dit Marler. Il a plaidé dans de nombreux cas très médiatisés de maladies d’origine alimentaire depuis 1993.

Les scientifiques peuvent être mieux à même de détecter les pathogènes avec le séquençage du génome entier, mais les tribunaux doivent encore estimer la valeur probante du nouveau test.

NB : Comme exemple récent, selon le Marler blog,

Le 10 juin, 2016, le séquençage du génome entier par la FDA d’isolats de E. coli O121 récupérés à partir d’un échantillon ouvert de farine de chez General Mills appartenant à l’un des consommateurs qui a été rendu malade a été retrouvé à être étroitement lié génétiquement avec des isolats cliniques de maladies humaines. La farine est venue d’un lot que General Mills a rappelée.

Le rapport annuel de la FSA sur les incidents alimentaires en 2015 publié

9
juin
Aucun commentaire
Classé dans Allergène, Contamination, Contamination croisée, Curiosité, E. coli, Environnement, Hygiène, Rappel, Réglementation, Salmonella, Santé, Sécurité des aliments, Union Européenne.

« Le rapport annuel de la FSA sur les incidents alimentaires en 2015 publié », source Food Standards Agency, dernière mise à jour 9 juin 2016.

La Food Standards Agency a publié aujourd’hui son dernier rapport annuel des incidents alimentaires. Il montre qu’en 2015, la FSA et la Food Standards Scotland ont notifié 1 514 incidents liés aux aliments, aux aliments pour animaux et à la contamination environnementale étudiés et gérés au Royaume-Uni.

Le nombre total d’incidents était similaire à celui observé au cours des dernières années. Cependant, dans la plupart des catégories, le nombre d’incidents différent considérablement d’année en année.

Les quatre plus grands contributeurs au nombre total d’incidents enregistrés en 2015 étaient :

  • Micro-organismes pathogènes (18%Allergènes (14%)
  • Contamination chimique (autres) (12%)
  • Résidus de médicaments vétérinaires (8%)

0013729e47710f64e50225Selon le rapport :

Micro-organismes pathogènes : En 2015, 67% des incidents comprenaient des micro-organismes pathogènes liés à Salmonella ou Escherichia coli. Cependant, 49 des 75 incidents à E. coli résultaient de la surveillance des mollusques et des crustacés. Il existe de nombreux types de E. coli. Certains vivent sans danger dans les intestins des humains et des animaux, alors que les souches pathogènes peuvent causer une maladie si l’aliment contaminé est consommé. Un dénombrement élevé de E. coli peut signifier un risque que des pathogènes fécaux soient présents et soient utilisés comme un indicateur de mauvaises conditions d’hygiène, mais ils ne sont pas nécessairement dangereux.

Allergènes : Le nombre d’incidents liés aux allergènes a augmenté de 89 en 2013 à 206 en 2015. Cela peut être lié aux nouvelles règles sur la présence d’informations sur les ingrédients allergènes mise en œuvre en décembre 2014.

Résidus de médicaments vétérinaires : Suite d’un changement dans les procédures d’établissement des rapports, la fréquence des incidents en médecine vétérinaire en 2014 et en 2015 est beaucoup plus élevée qu’en 2013. Depuis la fin de 2013, la FSA est informée de plus de résultats liés aux programmes de surveillance.

Contamination chimique (autre) : En 2015, les incendies ont été la cause de presque tous les (autres) incidents de contamination par des produits chimiques.

Plus de la moitié des incidents en 2015 ont été signalés par les autorités locales (409), les États membre de l’UE et la Commission européenne (213) ou les agences du gouvernement central (210). En outre, l’industrie a signalé 154 incidents en 2015.

Les mesures prises pour protéger les consommateurs en matière de sécurité des aliments a inclus 156 alertes et avis d’information aux autorités locales. La FSA a également envoyé 337 notifications à la Commission européenne, par l’intermédiaire du système d’alerte rapide pour les denrées alimentaires et les aliments pour animaux (RASFF).

NB : A noter que les Corps étrangers ont représenté 5% nombre total d’incidents enregistrés en 2015. Le Royaume-Uni est des plus importants contributeurs en notification via le RASFF.