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Glyphosate : La Suisse fait-elle preuve de bravitude ?

28
juil
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Classé dans Contamination, Curiosité, Environnement, Non classé, Réglementation, Santé, Sécurité des aliments, Union Européenne.

L’Office fédéral de la sécurité alimentaire et des affaires vétérinaires (OSAV) a publié le 4 juillet 2016 une fiche thématique sur le glyphosate dont je ne résiste pas de vous présenter l’essentiel …

Glyphosate

Avant de pouvoir être commercialisés et utilisés, les produits phytosanitaires sont soumis à une procédure d’autorisation longue et complexe. Dans ce cadre, l’Office fédéral de la sécurité alimentaire et des affaires vétérinaires (OSAV) est responsable de l’évaluation du risque pour la santé et de la fixation des concentrations maximales de résidus dans les denrées alimentaires. L’autorisation et l’interdiction des produits sont de la compétence de l’Office fédéral de l’agriculture (OFAG).

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En mars 2015, le Centre international de recherche sur le cancer (CIRC) de l’OMS a classé le glyphosate parmi les « cancérogènes probables » lors d’une autre analyse. Dans le cadre de sa nouvelle évaluation du glyphosate réalisée le 12 novembre 2015, l’EFSA, l’Autorité européenne de sécurité des aliments, a également évalué son potentiel cancérogène et pris position sur l’estimation du CIRC. Contrairement à ce dernier, l’EFSA parvient à la conclusion que le glyphosate n’est probablement ni mutagène, ni cancérogène.

Suite à la recommandation d’une force opérationnelle de l’OMS, le glyphosate a été de nouveau évalué du 9 au 13 mai 2016 lors d’une réunion extraordinaire, à Genève, par des experts de la JMPR. Ces derniers ont estimé qu’il était peu probable que le glyphosate présente un risque cancérogène pour l’homme via l’alimentation. Ces résultats confirment ainsi le point de vue de l’EFSA et celui de l’OSAV. La JMPR applique un autre concept d’évaluation que le CIRC: elle évalue en effet le risque potentiel que représentent pour l’homme les résidus pouvant subsister dans la nourriture suite à l’utilisation de produits phytosanitaires dans des conditions réalistes. Au contraire, le CIRC évalue le potentiel cancérogène indépendamment de la dose.

Le 28 juin 2016, la Commission de l’UE a décidé de prolonger de 18 mois l’autorisation du glyphosate. Dans ce laps de temps, l’ECHA, Agence européenne des produits chimiques, devra évaluer si le glyphosate est vraiment cancérigène. L’ECHA est l’agence responsable de la classification et de l’étiquetage des substances chimiques dans l’UE conformément à la législation sur les substances dangereuses. Comme d’autres comités d’experts reconnus internationalement, l’OSAV juge peu probable que le glyphosate présente un risque cancérogène pour l’homme via l’alimentation. Du point de vue sanitaire, il ne voit donc pas l’utilité de modifier les valeurs maximales en vigueur ou de prendre d’autres mesures visant à réduire l’exposition.

Les progrès considérables réalisés ces dernières années dans les techniques d’analyse des substances permettent aujourd’hui d’identifier les plus infimes concentrations de substances dans les matrices les plus diverses (denrées alimentaires, eau souterraine, tissus corporels et liquides tels que l’urine et le sang, etc.). Il n’est donc pas étonnant que des traces de produits chimiques soient de plus en plus souvent attestées dans le corps humain. Cela est particulièrement valable pour le glyphosate puisqu’il est non persistant et efficacement éliminé sous forme d’urine. Les résultats de la mesure d’échantillons d’urine effectuée par une organisation de consommateurs montrent que les valeurs trouvées sont infimes (0,9 microgramme par litre au maximum). Si on convertit la concentration d’urine maximale mesurée (0,9 microgramme par litre), on obtient une dose plus de 3 000 fois inférieure à la dose actuelle de référence, ce que l’on peut donc considérer comme ne présentant pas de risque sanitaire.

Certaines bactéries de l’intestin de l’homme descendraient de nos lointains ancêtres

23
juil
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Classé dans Curiosité, Environnement, Microbiologie, Santé.

« Certaines bactéries de l’intestin de l’homme descendraient de nos lointains ancêtres », source communiqué de l’Université du Texas à Austin.

Certaines des bactéries de nos intestins étaient présentes depuis des millions d’années, avant nous soyons des hommes, ce qui suggère que l’évolution a joué un rôle plus important dans ce qui était précédemment connu dans la relation intestin-microbes chez les personnes, selon une nouvelle étude parue dans la revue Science.

Les bactéries que les chercheurs ont étudiées guident le développement précoce de notre intestin, forment notre système immunitaire pour lutter contre les pathogènes et peuvent même affecter nos humeurs et nos comportements.

La recherche, qui comprenait une équipe internationale de scientifiques, a été dirigée par Howard Ochman, professeur de biologie intégrative à l’Université du Texas (UT) à Austin, et Andrew Moeller, un ancien étudiant diplômé de l’UT à Austin, actuellement chercheur postdoc à l’Université de Californie, Berkeley.

« Il est surprenant que nos microbes intestinaux, que nous pourrions obtenir de nombreuses sources dans l’environnement, ont co-évolué effectivement à l’intérieur de nous pendant une si longue période », dit Ochman, qui a noté que les microbes ont été transmis pendant des centaines de milliers de générations hôtes.

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Les scientifiques ont reconstitué l’arbre généalogique des hominidés sur la base de fossiles et des preuves génétiques. Reproduit avec la permission de Moeller et al., Science Science 22 Vol. 353, Issue 6297, pp. 380-382. Illustration par Andrew Moeller.

Comme les humains et les grands singes africains ont évolué en espèces distinctes d’un ancêtre commun, les bactéries présentes dans leur ancêtre commun ont également évolué dans des souches distinctes associées à chaque hôte, ont trouvé les scientifiques.

Ajoutant plus de poids à l’analyse, les scientifiques ont trouvé des preuves génétiques que les bactéries se sont divisées en souches distinctes en même temps que leurs hôtes se séparaient en espèces distinctes. Une telle scission bactérienne est arrivée il y a environ 15 600 000 années alors que la lignée des gorilles a divergé de autres hominidés. L’autre fraction bactérienne est arrivée il y a environ 5,3 millions d’années alors que la lignée humaine s’est séparée de la lignée conduisant aux chimpanzés et les bonobos.

« Nous savons depuis longtemps que les humains et nos plus proches parents, les grands singes, hébergent ces bactéries dans nos intestins », dit Moeller « et la plus grande question à laquelle nous voulions répondre est, d’où ces bactéries proviennent ? Est-ce que nous les avons obtenues de notre environnement ou de notre histoire évolutive ? Et combien de temps ont-elles persisté dans les lignées de l’hôte ? »

Avant cette étude, les scientifiques étaient en désaccord quant à savoir si les souches de microbes intestinaux ont continué dans les lignées individuelles d’hominidés sur des périodes suffisamment longues pour mener à une co-spéciation, un processus par lequel deux espèces évoluent en parallèle. La persistance de certains microbes aurait été menacée par des changements du régime alimentaire, la géographie ou l’utilisation d’antibiotiques.

Les chercheurs ont étudié des échantillons fécaux prélevés de grands singes sauvages africains – chimpanzés, bonobos et gorilles – et aussi de personnes vivant dans le Connecticut. Des preuves fossiles et génétiques ont établi que les quatre espèces, appelées hominidés, ont évolué à partir d’un ancêtre commun qui vivait il y a plus de 10 millions d’années.

Des échantillons fécaux contiennent des microbes hangar de l’intestin d’un animal hôte. Les scientifiques ont utilisé le séquençage des gènes pour analyser toutes les différentes versions d’un gène spécifique des bactéries présentes dans chaque échantillon de selles. A partir de ces données, ils ont reconstruit les arbres évolutifs pour trois groupes de bactéries intestinales qui constituent plus de 20 pour cent du microbiome intestinal humain.

Pour deux de ces groupes, Bacteroidaceae et Bifidobacteriaceae, les arbres évolutionnaires bactériennes ressemblent l’arbre de l’évolution des hominidés. Il existe quelques différences subtiles, cependant, bien qu’une souche bactérienne individuelle disparait de l’une des quatre espèces d’hôtes dans le temps.

Le troisième arbre de la famille bactérienne, d’un groupe connu sous le nom Lachnospiraceae, était plus compliqué. Il y en avait apparemment au moins quatre fois plus lorsque ces bactéries ont été transférés entre les différentes espèces d’hôtes. Les chercheurs pensent que c’est parce que ces bactéries ont formé des spores et pouvaient ainsi survivre à l’extérieur de leurs hôtes pendant de longues périodes, elles ont été facilement transmises entre les espèces.

Les chercheurs ne sont pas certains comment ces trois anciennes souches de microbes ont été transmises d’une génération hôte à une autre pendant des millions d’années. Avant que cette recherche ne le montre, nous recevons notre première inoculation de microbes de l’intestin de nos mères quand nous passons à travers le canal de la naissance. Tout au long de la vie, nous recevons aussi des microbes à partir d’interactions sociales. Les chercheurs soupçonnent que les deux modes de transmission sont responsables du maintien de notre relation multi-générationnelle avec nos bactéries BFF (best food friend).

« Ce qui est le plus excitant pour moi est la possibilité que cette co-diversification entre les bactéries et les hôtes pourrait s’étendre beaucoup plus loin dans le temps », dit Moeller. « Peut-être que nous pouvons tracer nos microbes intestinaux à nos ancêtres communs avec tous les mammifères, les reptiles, les amphibiens, peut-être même tous les vertébrés. Et si cela est vrai, c’est incroyable. »

En plus d’Ochman et Moeller, les co-auteurs de l’étude sont : Alejandro Caro-Quintero à Corpoicá C.I Tibaitata (Colombie) ; Deus Mjungu au Gombe Stream Research Center (Tanzanie) ; Alexander Georgiev à la Northwestern University et Harvard University ; Elizabeth Lonsdorf au Franklin & Marshall College ; Martin Muller de l’Université du Nouveau Mexique ; Anne Pusey de la Duke University ; Martine Peeters de l’Université de Montpellier (France) et Béatrice Hahn de l’Université de Pennsylvanie.

Cette étude a été soutenue par le National Institutes of Health, l’Agence Nationale de Recherche sur le Sida, le Jane Goodall Institute, l’Arthur L. Greene Fund et la Harvard University.

Persistance et élimination des norovirus humains dans les aliments et sur les surfaces en contact avec les aliments : mythes et réalités

17
juil
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Classé dans Contamination, Contamination croisée, Curiosité, Environnement, Hygiène, Lavage des mains, Microbiologie, Santé, Sécurité des aliments, Virus.

Résumé.

desinfectant_mainsCette revue critique porte sur la persistance de norovirus humains (NoV) dans l’eau, les coquillages et les viandes transformées mais aussi sur les baies, les herbes, les légumes, les fruits et les salades et sur les surfaces de contact avec les aliments. La revue se concentre sur les études utilisant des NoV, les informations provenant d’études impliquant uniquement des substituts aux NoV ne sont pas incluses. Elle aborde également l’élimination ou l’inactivation de NoV par divers traitements chimiques, physiques ou de transformation. Dans la plupart des études, la persistance ou l’élimination a été déterminée par la détection et la quantification du génome viral, bien que des procédés améliorés pour la détermination de l’infectivité aient été proposés. NoV a persisté pendant 60 à 728 jours dans de l’eau, selon la source d’eau. Il a également persisté sur des baies, des légumes et des fruits, montrant souvent une réduction de < 1 log en 1 à 2 semaines. NoV était résilient sur des tapis, du formica, de l’acier inoxydable, du chlorure de polyvinyle et des surfaces en céramique mais aussi durant la purification des coquillages et à des cycles répétés de congélation-décongélation. Les surfaces en alliage de cuivre peuvent inactiver NoV en endommageant la capside virale. La désinfection a été réalisé pour certains aliments ou des surfaces en contact avec les aliments en utilisant du chlore, de l’hypochlorite de calcium ou de sodium, du dioxyde de chlore, une pression hydrostatique élevée, des températures élevées, des valeurs de pH > 8,0, la lyophilisation et le rayonnement UV. Les désinfectants inefficaces comprennent le peroxyde d’hydrogène, des composés d’ammonium quaternaire, la plupart des désinfectants à base d’éthanol et les antiseptiques aux concentrations normalement utilisées. Un lavage intensif des herbes et des produits frais est efficace pour réduire, mais pas pour éliminer NoV dans la plupart des produits frais. Se laver les mains avec du savon réduit  généralement NoV de < 2 log. Des recommandations pour de futurs besoins de recherche sont fournis.

CombatNoroRéférence. Cook, Nigel; Knight, Angus; Richards, Gary P. Persistence and Elimination of Human Norovirus in Food and on Food Contact Surfaces: A Critical Review. Journal of Food Protection®, Volume 79, Number 7, July 2016, pp. 1273-1294(22).

En France, on peut lire dans un avis de l’Agence française de sécurité sanitaire des produits de santé devenue depuis l’Agence nationale de sécurité des médicaments et des produits de santé (Ansm) relatif à l’efficacité de désinfectants pour les mains à peau saine (produits hydro-alcooliques ; PHA) vis-à-vis du Norovirus humain :

l’Afssaps estime qu’un PHA est considéré actif vis-à-vis du Norovirus humain s’il répond totalement à la norme européenne EN 14 476 (18) (actif sur adénovirus et sur poliovirus) pour la durée de friction revendiquée.

Dans le cas où le produit ne répond que partiellement à la norme EN 14 476 (actif uniquement sur adénovirus et inactif sur poliovirus), un essai supplémentaire sur un virus modèle (ex Norovirus murin) selon le protocole de la norme EN 14 476 est alors nécessaire pour prouver l’activité du produit sur Norovirus.

On pourrait sans doute ici revoir la procédure à la lecture de cette revue critique et l’Anses qui gère désormais les produits biocides serait bien inspirée de faire le ménage dans des indications qui ne semblent pas correspondre à la réalité scientifique.

Des scientifiques simulent une ‘éolienne’ alimentée par des bactéries

16
juil
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Classé dans Curiosité, Environnement, Microbiologie.

« Des scientifiques simulent une ‘éolienne’ alimentée par des bactéries », source communiqué de l’université d’Oxford.

Une équipe de scientifiques de l’Université d’Oxford a montré comment le mouvement naturel des bactéries pouvait être exploité pour s’assembler et alimenter des ‘éoliennes’ microscopiques.

bacteria windfarmL’étude, publiée dans Science Avances*, utilise des simulations informatiques pour démontrer que l’effet de la masse chaotique de la matière active dense telle que celle des bactéries peut être organisée pour faire tourner des rotors cylindriques et fournir une source d’énergie stable.

Les chercheurs disent que ces centrales biologiquement entraînées pourraient un jour être des moteurs microscopiques pour de petits appareils fabriqués par l’homme qui sont auto-assemblés et auto-alimentés.

Le co-auteur, le Dr Tyler Shendruk du département de physique de l’université d’Oxford, a dit : « Un grand nombre de défis énergétiques de la société sont à l’échelle du gigawatt, mais certains sont carrément microscopiques. Un moyen potentiel de générer des quantités infimes de puissance pour des micromachines pourrait être de la récupérer directement à partir de systèmes biologiques tels que des bactéries en suspension. »

Les suspensions bactériennes denses sont l’exemple par excellence des fluides actifs qui coulent spontanément. Les bactéries en suspension sont capables de se multiplier et de conduire des flux vivants désorganisés, qui sont normalement trop désordonnés pour en extraire toute la puissance utile.

Mais quand l’équipe d’Oxford a immergé un réseau de 64 micro-rotors symétriques dans ce fluide actif, les scientifiques ont constaté que les bactéries s’organisent spontanément de telle manière que les rotors voisins ont commencé à tourner dans des directions opposées, une organisation structurelle simple, qui rappelle celle d’un parc éolien.

Le Dr Shendruk a ajouté : « La chose étonnante est que nous ne disposions pas de turbines préconçues microscopiques en forme d’engrenage. Des rotors simplement auto-assemblés en une sorte de parc éolien bactérien. »

« Quand nous avons fait la simulation avec un seul rotor dans la turbulence bactérienne, il a juste virer de façon aléatoire. Mais lorsque nous avons mis un réseau de rotors dans le liquide vivant, ils formaient soudain un motif régulier, avec les rotors voisins tournant dans des directions opposées. »

Le co-auteur, le Dr Amin Doostmohammadi, du département de physique de l’université d’Oxford, a dit : « La capacité à obtenir même une petite quantité de travail mécanique à partir de ces systèmes biologiques est précieuse, car ils ne nécessitent pas de puissance d’entrée et utilisent des processus biochimiques internes pour se déplacer. »

« A micro-échelle, les simulations montrent que le flux généré par les assemblages biologiques est capable de se réorganiser, de manière à générer une puissance mécanique persistante pour faire tourner un réseau de micro-rotors. »

L’auteur principal, le professeur Julia Yeomans, du département de physique de l’université d’Oxford, a ajouté : « La nature est brillante pour créer des moteurs minuscules, et il y a un énorme potentiel si nous pouvons comprendre comment exploiter des conceptions similaires. »

* l’article est disponible intégralement et gratuitement.

NB : L’article a été présenté par différentes revues sous les titres suivants :

  • « Tiny bacteria-powered ‘windfarm’ for your phone? » pour Science Daily
  • « Engines of the Future: How Tiny Bacteria Could Power Your Smartphone » pour Nature World News

Y en aurait-il que pour le smartphone ?

Découverte d’un nouveau système de défense biologique pour éliminer les pathogènes microbiens

12
juil
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Classé dans Contamination, Curiosité, Environnement, Microbiologie, Santé.

« Découverte d’un nouveau système de défense biologique pour éliminer les pathogènes microbiens », source communiqué de l’université d’Osaka.

Un groupe de chercheurs dirigé par lep rofesseur adjoint Hirayasu Kouyuki et le professeur Arase Hisashi (Immunology Frontier Research Center/Research Institute for Microbial Diseases, Osaka University) a découvert des récepteurs humains qui détectent l’invasion des pathogènes microbiens et a constaté qu’ils ont travaillé comme un système de défense biologique, une première mondiale.

Les pathogènes microbiens se battent contre le système de défense biologique de l’hôte en fabricant une variété de protéines. Comme l’un de leurs mécanismes moléculaires, il est connu que les protéases microbiennes clivent les anticorps de l’hôte. Si les anticorps sont clivés, l’hôte ne peut pas se débarrasser des pathogènes microbiens. Cependant, des contre-mesures prises par l’hôte contre de tels mécanismes immunitaires microbiens d’évasion ne sont pas bien compris.

Dans cette étude, il a été constaté que les récepteurs qui reconnaissent les anticorps clivés étaient chez l’hôte, et qu’ils se sont battus contre les mécanismes immunitaires microbiens d’évasion. Afin de trouver comment les cellules immunitaires reconnaissent les pathogènes microbiens et comment elles sont impliqués dans la défense biologique, ce groupe a examiné des souches de cellules humaines infectées par Mycoplasma comme modèle de pathogène microbien et a constaté que le récepteur immunologiquement actif LILRA2 (leukocyte immunoglobulin-like receptor A2), dont la fonction n’est pas connue, a reconnu les cellules infectées par Mycoplasma. En outre, ce groupe a examiné des molécules reconnues par LILRA2 sur des cellules infectées par Mycoplasma et a constaté que LILRA2 a reconnu les anticorps qui ont été clivés par la protéase produite par Mycoplasma.

En plus de Mycoplasma, Legionella, Pneumococcus, Haemophilus influenza et Candida ont également produit des protéases et des anticorps clivés. Legionella infecte les cellules immunitaires et se multiplier dans les cellules. Il a été constaté que, lorsque LILRA2 est exprimé sur des cellules immunitaires il reconnait les anticorps clivés, la prolifération de Legionella dans les cellules est prévenue. En outre, il a été constaté que, dans la tympanite, l’athérome inflammatoire, la cellulite, et d’autres endroits infectés par des bactéries, des anticorps ont été clivés par la protéase, activant des cellules exprimant LILRA2.

De cette façon, ce groupe a découvert en première mondiale que LILRA2 a reconnu des anticorps clivés par des pathogènes microbiens, servant de système de défense biologique. En d’autres termes, on pense que les mécanismes d’évasion du système immunitaire dans lequel les pathogènes microbiens clivent les anticorps sont capturés par le système de défense biologique de l’hôte par l’intermédiaire du LILRA2. Le contrôle de LILRA2 à travers les réalisations de ce groupe contribuera à l’élaboration de méthodes de traitement et de prévention des maladies infectieuses.

NB : Pour en savoir plus sur cette recherche, voir l’article en intégralité intitulé « Microbially cleaved immunoglobulins are sensed by the innate immune receptor LILRA2 » sur le site Internet de Nature ?

20160426-11

Nouveau concept pour le système de défense de l’hôte contre les agents pathogènes microbiens

Les anticorps jouent un rôle important dans la défense de l’hôte contre les pathogènes microbiens. Cependant, les pathogènes microbiens semblent avoir acquis une protéase qui détruit des anticorps afin de se soustraire du système immunitaire de l’hôte. D’autre part, le système immunitaire de l’hôte semble avoir acquis un récepteur d’activation immunitaire, LILRA2, qui reconnaît spécifiquement les anticorps clivés par voie microbienne.